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中国农业科学院研究生院沼气所开设有6个专业，微生物学、生物化学与分子生物学、农业生物环境与能源工程、环境科学、环境工程、资源利用与植物保护等。以下是中国农业科学院研究生院沼气所的专业目录，参考书目，复试分数线等信息。
中国农业科学院研究生院沼气所研究生招生目录及参考书目| 专业信息 | 研究方向 | 考试科目 | 招生人数 |
微生物学[071005] | 02环境微生物与农业生态 | ①101思想政治理论②201英语一③702化学④801生物化学（含分子生物学） | |
生物化学与分子生物学[071010] | 04微生物分子生物学与基因工程 | ①101思想政治理论②201英语一③702化学④ | |
农业生物环境与能源工程[082803] | 02沼气工程 | ①101思想政治理论②201英语一③302数学二 | |
环境科学[083001] | 01环境污染与修复 | ①101思想政治理论②201英语一③302数学二 | |
环境工程[083002] | 01农业废弃物处理与利用 | ①101思想政治理论②201英语一③302数学二 | |
资源利用与植物保护[095132] | (2)非全日制00农业资源利用 | ①101思想政治理论②204英语二③339农业知识综合一④833高级土壤学或834植物营养学 |
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